Los cambios introducidos en el Monotributo hicieron que se convirtiera en algo un más "complicado" para algunos pequeños contribuyentes. La simple cuota que unificaba en un pago el Impuesto al Valor Agregado (IVA), a las Ganancias y aportes jubilatorios y a la obra social, se fueron incorporando otras obligaciones. Los usos y abusos hicieron que la AFIP fuera intensificando los controles.

La recategorización cuatrimestral es necesario tener en cuenta cuáles son los ingresos obtenidos, la energía consumida y los alquileres devengados para saber si corresponde o no avanzar de categoría o si puede seguir permaneciendo en el Monotributo. Si el contribuyente  además realiza alguna otra actividad que no está alcanzada por el régimen simplificado, la cosa se puede complicar aún más.  Los  ingresos extra podrían estar alcanzados por el régimen general y pagar impuesto a las ganancias. 

En una reciente causa  fue condenada a pagar Ganancias por una actividad realizada en relación de dependencia y que no había sido considerada al momento de inscribirse al Monotributo.

Los agentes del fisco argumentaron que, pese a estar adherido al Monotributo, no estaba abonando el gravamen por el cargo que ejercía como encargado de una de las seccionales del Registro Nacional de la Propiedad Automotor en la provincia de Jujuy. Ninguna ley establece una prohibición para que una persona pueda estar bajo ambos regímenes.

Por el contrario, señalaron que la actividad declarada en el régimen simplificado no lo eximía del pago de Ganancias por la actividad desarrollada en relación de dependencia en el Registro de Propiedad Automotor.